In der Unterwelt eines kleinen Städtchens hausen die Boxtrolls, die von den Stadtbewohnern zu Unrecht gefürchtet werden, denn eigentlich sind sie liebenswürdige Wesen. Bei ihnen lebt der Junge Eggs, den sie als KleinkondKleinkind aufgenommen haben. Doch der Fiesling Snatcher will die Boxtrolls vernichten um von der Stadt mehr Macht zu bekommen.