Das im Vorgängerfilm verunglückte Schiff Poseidon treibt im Mittelmeer. Die Überlebenden Wilbur Hubbard und Celeste Whitman sowie der Kapitän Mike Turner organisieren eine Expedition mit dem Ziel, die kostbare Ladung zu bergen. Ähnliches Ziel verfolgt das zweite Team um Stefan Svevo, der ein getarnter Terrorist ist. Ihn interessiert vor allem das mit dem Schiff transportierte Plutonium. Die Teams betreten das Schiff, wo sie weitere Überlebenden finden. Dazu gehören Frank Mazzetti, der seine verschollene Tochter sucht und die Krankenschwester Gina Rowe, die die Eheleute Harold und Hannah Meredith begleiten. Währenddessen strömt das Wasser weiterhin in die Schiffsräume. Am Ende stirbt die Mannschaft um Svevo während das Team um Turner mit dem gefundenen Gold Athen erreicht.